שר התחבורה הודיע ב-13/6/01 שלאחר שבחן את התוכניות השונות לגבי קו רכבת בין תל-אביב לירושלים, הגיע למסקנה שהטובה מבניהן היא קו מהיר, העובר דרך נתב"ג ובסמוך לעיר מודיעין. זמן הנסיעה בקו זה יהיה כחצי שעה. ואולם, בשל מורכבות הפרויקט והזמן הדרוש למימושו (שמונה שנים לפי הערכות אופטימיות), החליט סנה להמליץ לממשלה להתחיל מיד, ובמקביל לקידום הקו המהיר, בשיפוץ הקו הישן בין תל-אביב לירושלים, שהושבת לפני כמה שנים.
שיפוץ הקו הישן, העובר דרך לוד ובית שמש, יעלה כ-85 מיליון דולרים. לפי הערכת הרכבת יארכו העבודות שנתיים. 60 מיליון דולר נוספים יעלו רכבות מסוג 'טילטינג'. זמן הנסיעה מתל-אביב לירושלים בקו המשופץ מוערך בכשעה. בירושלים תעצור הרכבת במלחה ובתחנת החאן שבמרכז העיר. הקו יתן מענה גם לתושבי בית-שמש, אחת מהערים הגדולות בישראל.
עלות הקו המהיר היא 527 מיליון דולר, ועוד 120 מיליון דולר לרכישת רכבות. מתוכננת בו מסילה כפולה וחשמלית, שיסעו בה 4 רכבות לשעה בכל כיוון.
מקורות במשרד האוצר טוענים כי ההחלטה של שר התחבורה אינה כדאית ואינה מעשית. לדבריהם, כדי לקצר את זמן הנסיעה לכ-55 דקות יש צורך לשדרג את התוואי בעלות המוערכת ב-110 מיליון דולר. המקורות אמרו עוד כי שדרוג הקו כולל הסטת התוואי בכמה מהמקומות, דבר שיחייב קבלת אישורים סטטוטוריים ויעורר התנגדות של גופים ירוקים משום שיעבור בשמורות טבע. האוצר תומך בהקמת הקו המהיר.
מקור: 'הארץ'